Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE1CQ14123 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE1CQ14123 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1CQ14123 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE1CQ14123 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE1CQ14123 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE1CQ14123 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE1CQ14123 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1CQ14123 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE1CQ14123 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE1CQ14123 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE1CQ14123 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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