Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE6HQ13956 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE6HQ13956 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE6HQ13956 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE6HQ13956 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE6HQ13956 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE6HQ13956 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE6HQ13956 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDE6HQ13956 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE6HQ13956 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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