Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOFQ13790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOFQ13790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
APOFQ13790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOFQ13790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOFQ13790 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOFQ13790 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOFQ13790 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOFQ13790 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOFQ13790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOFQ13790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOFQ13790 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOFQ13790 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOFQ13790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOFQ13790 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOFQ13790 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOFQ13790 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOFQ13790 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOFQ13790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOFQ13790 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOFQ13790 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOFQ13790 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOFQ13790 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOFQ13790 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOFQ13790 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOFQ13790 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOFQ13790 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOFQ13790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOFQ13790 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOFQ13790 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOFQ13790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOFQ13790 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOFQ13790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOFQ13790 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOFQ13790 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOFQ13790 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOFQ13790 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOFQ13790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOFQ13790 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOFQ13790 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOFQ13790 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOFQ13790 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOFQ13790 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOFQ13790 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOFQ13790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOFQ13790 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOFQ13790 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOFQ13790 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOFQ13790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOFQ13790 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOFQ13790 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOFQ13790 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOFQ13790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOFQ13790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOFQ13790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOFQ13790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOFQ13790 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOFQ13790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOFQ13790 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOFQ13790 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOFQ13790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOFQ13790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOFQ13790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOFQ13790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOFQ13790 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOFQ13790 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOFQ13790 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOFQ13790 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOFQ13790 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOFQ13790 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOFQ13790 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOFQ13790 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOFQ13790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOFQ13790 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOFQ13790 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOFQ13790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOFQ13790 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOFQ13790 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOFQ13790 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOFQ13790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOFQ13790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOFQ13790 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOFQ13790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOFQ13790 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOFQ13790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOFQ13790 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOFQ13790 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOFQ13790 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOFQ13790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOFQ13790 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOFQ13790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOFQ13790 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOFQ13790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOFQ13790 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOFQ13790 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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