Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBA3CQ13748 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBA3CQ13748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA3CQ13748 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA3CQ13748 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA3CQ13748 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBA3CQ13748 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBA3CQ13748 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBA3CQ13748 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA3CQ13748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBA3CQ13748 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBA3CQ13748 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBA3CQ13748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBA3CQ13748 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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