Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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