Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRR1Q13601 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRR1Q13601 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRR1Q13601 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRR1Q13601 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRR1Q13601 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRR1Q13601 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRR1Q13601 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRR1Q13601 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRR1Q13601 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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