Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PICALMQ13492 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PICALMQ13492 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PICALMQ13492 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PICALMQ13492 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PICALMQ13492 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PICALMQ13492 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PICALMQ13492 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PICALMQ13492 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PICALMQ13492 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PICALMQ13492 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PICALMQ13492 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PICALMQ13492 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PICALMQ13492 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PICALMQ13492 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PICALMQ13492 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PICALMQ13492 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PICALMQ13492 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PICALMQ13492 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PICALMQ13492 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PICALMQ13492 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PICALMQ13492 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PICALMQ13492 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PICALMQ13492 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PICALMQ13492 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PICALMQ13492 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PICALMQ13492 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
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