Protein–RNA interactions for Protein: Q13459

MYO9B, Unconventional myosin-IXb, humanhuman

Predictions only

Length 2,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9BQ13459 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYO9BQ13459 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYO9BQ13459 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
MYO9BQ13459 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYO9BQ13459 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MYO9BQ13459 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MYO9BQ13459 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MYO9BQ13459 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MYO9BQ13459 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
MYO9BQ13459 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MYO9BQ13459 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MYO9BQ13459 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYO9BQ13459 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYO9BQ13459 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO9BQ13459 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYO9BQ13459 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MYO9BQ13459 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYO9BQ13459 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO9BQ13459 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYO9BQ13459 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYO9BQ13459 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYO9BQ13459 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYO9BQ13459 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MYO9BQ13459 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms