Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNTA1Q13424 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNTA1Q13424 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNTA1Q13424 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNTA1Q13424 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNTA1Q13424 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNTA1Q13424 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNTA1Q13424 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNTA1Q13424 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNTA1Q13424 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNTA1Q13424 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNTA1Q13424 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNTA1Q13424 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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