Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL49Q13405 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL49Q13405 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL49Q13405 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL49Q13405 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL49Q13405 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL49Q13405 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL49Q13405 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL49Q13405 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL49Q13405 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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