Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHAF1AQ13111 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHAF1AQ13111 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHAF1AQ13111 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHAF1AQ13111 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHAF1AQ13111 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CHAF1AQ13111 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHAF1AQ13111 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHAF1AQ13111 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHAF1AQ13111 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHAF1AQ13111 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHAF1AQ13111 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHAF1AQ13111 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHAF1AQ13111 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHAF1AQ13111 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHAF1AQ13111 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHAF1AQ13111 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHAF1AQ13111 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHAF1AQ13111 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHAF1AQ13111 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHAF1AQ13111 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHAF1AQ13111 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHAF1AQ13111 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CHAF1AQ13111 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHAF1AQ13111 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHAF1AQ13111 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHAF1AQ13111 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHAF1AQ13111 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHAF1AQ13111 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHAF1AQ13111 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHAF1AQ13111 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHAF1AQ13111 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHAF1AQ13111 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHAF1AQ13111 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms