Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ANK3Q12955 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ANK3Q12955 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANK3Q12955 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANK3Q12955 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ANK3Q12955 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ANK3Q12955 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ANK3Q12955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANK3Q12955 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANK3Q12955 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANK3Q12955 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ANK3Q12955 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANK3Q12955 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANK3Q12955 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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