Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAF2Q12933 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAF2Q12933 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAF2Q12933 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAF2Q12933 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAF2Q12933 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF2Q12933 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF2Q12933 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF2Q12933 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF2Q12933 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF2Q12933 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF2Q12933 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF2Q12933 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF2Q12933 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF2Q12933 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF2Q12933 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF2Q12933 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAF2Q12933 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF2Q12933 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF2Q12933 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF2Q12933 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF2Q12933 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF2Q12933 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF2Q12933 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF2Q12933 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms