Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC20Q12834 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC20Q12834 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC20Q12834 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC20Q12834 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC20Q12834 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC20Q12834 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC20Q12834 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC20Q12834 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC20Q12834 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC20Q12834 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC20Q12834 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC20Q12834 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC20Q12834 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC20Q12834 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC20Q12834 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC20Q12834 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms