Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 PHO92YDR374C 921 nt12.49□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 YKL030WYKL030W 606 nt12.47□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 LCB1YMR296C 1677 nt12.46□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 SKG1YKR100C 1068 nt12.46□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 PCM1YEL058W 1674 nt12.45□□□□□ -0.42
NCR1Q12200 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.45□□□□□ -0.42
NCR1Q12200 YLR235CYLR235C 399 nt12.45□□□□□ -0.42
NCR1Q12200 RRT12YCR045C 1476 nt12.44□□□□□ -0.42
NCR1Q12200 BDF1YLR399C 2061 nt12.43□□□□□ -0.42
NCR1Q12200 YHL050CYHL050C 2094 nt12.39□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 YDR094WYDR094W 336 nt12.37□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 YSC84YHR016C 1407 nt12.36□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 YHL044WYHL044W 708 nt12.35□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 DIC1YLR348C 897 nt12.35□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 SNF6YHL025W 999 nt12.34□□□□□ -0.43
NCR1Q12200 YIH1YCR059C 777 nt12.31□□□□□ -0.44
NCR1Q12200 AST1YBL069W 1290 nt12.3□□□□□ -0.44
NCR1Q12200 TIM23YNR017W 669 nt12.3□□□□□ -0.44
NCR1Q12200 RNQ1YCL028W 1218 nt12.3□□□□□ -0.44
NCR1Q12200 PAC11YDR488C 1602 nt12.27□□□□□ -0.44
NCR1Q12200 YNL195CYNL195C 786 nt12.27□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 STD1YOR047C 1335 nt12.25□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 TAT1YBR069C 1860 nt12.24□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.23□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 WSC2YNL283C 1512 nt12.22□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 RPM1RPM1 483 nt12.22□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 YLR179CYLR179C 606 nt12.21□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 URE2YNL229C 1065 nt12.21□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 BIO4YNR057C 714 nt12.21□□□□□ -0.45
NCR1Q12200 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
NCR1Q12200 YLL053CYLL053C 459 nt12.18□□□□□ -0.46
NCR1Q12200 AHT1YHR093W 549 nt12.17□□□□□ -0.46
NCR1Q12200 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt12.15□□□□□ -0.46
NCR1Q12200 SIM1YIL123W 1431 nt12.14□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.14□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 TOM20YGR082W 552 nt12.12□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt12.12□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 PRE6YOL038W 765 nt12.12□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 PEX27YOR193W 1131 nt12.12□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 NCP1YHR042W 2076 nt12.11□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 FTR1YER145C 1215 nt12.11□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 YFR018CYFR018C 1092 nt12.11□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 FAR3YMR052W 615 nt12.11□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 SEC11YIR022W 504 nt12.1□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 TAD3YLR316C 969 nt12.1□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 YPR064WYPR064W 420 nt12.1□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 PCH2YBR186W 1695 nt12.09□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 GAL1YBR020W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
NCR1Q12200 YPL071CYPL071C 471 nt12.07□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 TRM5YHR070W 1500 nt12.05□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 GUT2YIL155C 1950 nt12.05□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 YDR008CYDR008C 351 nt12.04□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 GTT3YEL017W 1014 nt12.04□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 PAU16YKL224C 372 nt12.04□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 ATF2YGR177C 1608 nt12.03□□□□□ -0.48
NCR1Q12200 PIB2YGL023C 1908 nt12.01□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 BDH1YAL060W 1149 nt12□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 HMT1YBR034C 1047 nt12□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 YFL066CYFL066C 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 AQY1YPR192W 918 nt11.99□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 LYS4YDR234W 2082 nt11.97□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 YSP3YOR003W 1437 nt11.96□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 SPC25YER018C 666 nt11.96□□□□□ -0.49
NCR1Q12200 STB1YNL309W 1263 nt11.95□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 CRR1YLR213C 1269 nt11.93□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 PUS9YDL036C 1389 nt11.92□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 LCP5YER127W 1074 nt11.91□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 ERF2YLR246W 1080 nt11.91□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 CCT4YDL143W 1587 nt11.9□□□□□ -0.5
NCR1Q12200 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.89□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 RRT5YFR032C 870 nt11.89□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 PEX25YPL112C 1185 nt11.89□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 VPS60YDR486C 690 nt11.87□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 YFL067WYFL067W 528 nt11.87□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 DDR2YOL052C-A 186 nt11.87□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 MET8YBR213W 825 nt11.87□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 ALG3YBL082C 1377 nt11.87□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 HAS1YMR290C 1518 nt11.86□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 LSM12YHR121W 564 nt11.86□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 RTF1YGL244W 1677 nt11.85□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.85□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 MIC10YCL057C-A 294 nt11.85□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 YNL115CYNL115C 1935 nt11.85□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 ANP1YEL036C 1503 nt11.85□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 IRC14YOR135C 342 nt11.84□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 SNG1YGR197C 1644 nt11.84□□□□□ -0.51
NCR1Q12200 YLR036CYLR036C 612 nt11.83□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 BOP3YNL042W 1191 nt11.82□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 GPI16YHR188C 1833 nt11.81□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 FEN2YCR028C 1539 nt11.81□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 SBA1YKL117W 651 nt11.81□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 YLR415CYLR415C 339 nt11.81□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 PTK1YKL198C 1989 nt11.78□□□□□ -0.52
NCR1Q12200 ARC19YKL013C 516 nt11.77□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 HEM12YDR047W 1089 nt11.76□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 URH1YDR400W 1023 nt11.75□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 MPS2YGL075C 1164 nt11.75□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 SWC5YBR231C 912 nt11.74□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 YEL074WYEL074W 339 nt11.73□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 NEJ1YLR265C 1029 nt11.73□□□□□ -0.53
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