Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASGEF1BQ0VAM2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASGEF1BQ0VAM2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGEF1BQ0VAM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGEF1BQ0VAM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RASGEF1BQ0VAM2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms