Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DSG1Q02413 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSG1Q02413 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSG1Q02413 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSG1Q02413 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSG1Q02413 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DSG1Q02413 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSG1Q02413 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DSG1Q02413 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DSG1Q02413 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DSG1Q02413 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DSG1Q02413 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DSG1Q02413 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSG1Q02413 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSG1Q02413 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSG1Q02413 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG1Q02413 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG1Q02413 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSG1Q02413 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSG1Q02413 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms