Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F1Q01094 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F1Q01094 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F1Q01094 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F1Q01094 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F1Q01094 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F1Q01094 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F1Q01094 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F1Q01094 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F1Q01094 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F1Q01094 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
E2F1Q01094 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F1Q01094 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F1Q01094 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F1Q01094 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F1Q01094 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms