Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTBN1Q01082 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTBN1Q01082 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPTBN1Q01082 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPTBN1Q01082 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPTBN1Q01082 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN1Q01082 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN1Q01082 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN1Q01082 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN1Q01082 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN1Q01082 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN1Q01082 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPTBN1Q01082 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPTBN1Q01082 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPTBN1Q01082 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN1Q01082 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTBN1Q01082 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTBN1Q01082 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTBN1Q01082 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTBN1Q01082 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTBN1Q01082 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTBN1Q01082 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTBN1Q01082 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTBN1Q01082 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTBN1Q01082 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms