Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAT1AQ00266 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAT1AQ00266 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAT1AQ00266 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAT1AQ00266 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAT1AQ00266 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAT1AQ00266 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAT1AQ00266 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAT1AQ00266 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAT1AQ00266 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAT1AQ00266 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MAT1AQ00266 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAT1AQ00266 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAT1AQ00266 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms