Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27AP62979 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27AP62979 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS27AP62979 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS27AP62979 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS27AP62979 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS27AP62979 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS27AP62979 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS27AP62979 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS27AP62979 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27AP62979 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27AP62979 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27AP62979 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27AP62979 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27AP62979 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27AP62979 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27AP62979 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms