Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS28P62857 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS28P62857 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPS28P62857 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS28P62857 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS28P62857 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS28P62857 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS28P62857 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS28P62857 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS28P62857 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS28P62857 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS28P62857 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS28P62857 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS28P62857 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS28P62857 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS28P62857 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS28P62857 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS28P62857 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS28P62857 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS28P62857 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS28P62857 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS28P62857 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS28P62857 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS28P62857 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS28P62857 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS28P62857 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS28P62857 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPS28P62857 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS28P62857 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPS28P62857 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS28P62857 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS28P62857 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS28P62857 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS28P62857 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPS28P62857 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS28P62857 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS28P62857 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPS28P62857 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS28P62857 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPS28P62857 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS28P62857 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS28P62857 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS28P62857 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPS28P62857 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS28P62857 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS28P62857 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS28P62857 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS28P62857 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPS28P62857 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS28P62857 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPS28P62857 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS28P62857 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS28P62857 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPS28P62857 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS28P62857 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS28P62857 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS28P62857 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS28P62857 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS28P62857 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS28P62857 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS28P62857 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS28P62857 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS28P62857 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS28P62857 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS28P62857 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS28P62857 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS28P62857 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS28P62857 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS28P62857 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS28P62857 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS28P62857 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS28P62857 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS28P62857 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS28P62857 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS28P62857 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS28P62857 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS28P62857 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS28P62857 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS28P62857 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS28P62857 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPS28P62857 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS28P62857 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPS28P62857 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPS28P62857 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS28P62857 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS28P62857 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS28P62857 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS28P62857 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS28P62857 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS28P62857 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS28P62857 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS28P62857 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS28P62857 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS28P62857 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS28P62857 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS28P62857 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS28P62857 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS28P62857 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS28P62857 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS28P62857 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms