Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2KP61086 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2KP61086 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2KP61086 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2KP61086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2KP61086 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2KP61086 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2KP61086 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2KP61086 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2KP61086 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms