Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPCS3P61009 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPCS3P61009 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPCS3P61009 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPCS3P61009 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPCS3P61009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPCS3P61009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPCS3P61009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPCS3P61009 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPCS3P61009 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPCS3P61009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPCS3P61009 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPCS3P61009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPCS3P61009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPCS3P61009 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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