Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIPPLY3P57055 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIPPLY3P57055 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPPLY3P57055 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPPLY3P57055 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPPLY3P57055 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPPLY3P57055 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPPLY3P57055 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY3P57055 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3P57055 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPPLY3P57055 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPPLY3P57055 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPPLY3P57055 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPPLY3P57055 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPPLY3P57055 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPPLY3P57055 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPPLY3P57055 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIPPLY3P57055 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPPLY3P57055 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIPPLY3P57055 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIPPLY3P57055 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms