Protein–RNA interactions for Protein: P57052

RBM11, Splicing regulator RBM11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM11P57052 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM11P57052 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM11P57052 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM11P57052 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM11P57052 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM11P57052 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM11P57052 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM11P57052 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM11P57052 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM11P57052 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM11P57052 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM11P57052 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM11P57052 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM11P57052 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM11P57052 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM11P57052 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM11P57052 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM11P57052 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM11P57052 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM11P57052 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM11P57052 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM11P57052 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM11P57052 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM11P57052 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM11P57052 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM11P57052 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM11P57052 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM11P57052 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM11P57052 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM11P57052 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM11P57052 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM11P57052 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM11P57052 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM11P57052 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM11P57052 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM11P57052 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM11P57052 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM11P57052 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM11P57052 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM11P57052 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM11P57052 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM11P57052 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM11P57052 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM11P57052 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM11P57052 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM11P57052 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM11P57052 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM11P57052 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM11P57052 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM11P57052 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM11P57052 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM11P57052 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM11P57052 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM11P57052 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM11P57052 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM11P57052 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM11P57052 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM11P57052 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM11P57052 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM11P57052 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM11P57052 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM11P57052 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM11P57052 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM11P57052 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBM11P57052 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM11P57052 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM11P57052 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM11P57052 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM11P57052 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM11P57052 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM11P57052 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM11P57052 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM11P57052 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM11P57052 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM11P57052 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM11P57052 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM11P57052 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM11P57052 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM11P57052 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM11P57052 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM11P57052 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM11P57052 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM11P57052 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM11P57052 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM11P57052 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM11P57052 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM11P57052 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM11P57052 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM11P57052 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM11P57052 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM11P57052 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM11P57052 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM11P57052 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM11P57052 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM11P57052 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM11P57052 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM11P57052 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM11P57052 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM11P57052 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM11P57052 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms