Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA1P56199 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA1P56199 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA1P56199 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA1P56199 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA1P56199 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA1P56199 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA1P56199 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA1P56199 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA1P56199 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms