Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPD52P55327 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPD52P55327 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPD52P55327 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPD52P55327 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPD52P55327 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPD52P55327 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPD52P55327 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPD52P55327 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPD52P55327 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPD52P55327 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPD52P55327 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TPD52P55327 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TPD52P55327 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPD52P55327 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPD52P55327 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TPD52P55327 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TPD52P55327 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPD52P55327 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPD52P55327 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPD52P55327 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPD52P55327 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPD52P55327 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPD52P55327 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPD52P55327 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPD52P55327 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPD52P55327 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPD52P55327 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPD52P55327 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPD52P55327 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPD52P55327 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPD52P55327 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPD52P55327 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TPD52P55327 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPD52P55327 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TPD52P55327 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TPD52P55327 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPD52P55327 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPD52P55327 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPD52P55327 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TPD52P55327 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TPD52P55327 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPD52P55327 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TPD52P55327 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPD52P55327 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPD52P55327 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TPD52P55327 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPD52P55327 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TPD52P55327 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TPD52P55327 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPD52P55327 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPD52P55327 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPD52P55327 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPD52P55327 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPD52P55327 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPD52P55327 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPD52P55327 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPD52P55327 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPD52P55327 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPD52P55327 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPD52P55327 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPD52P55327 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPD52P55327 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPD52P55327 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPD52P55327 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPD52P55327 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPD52P55327 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPD52P55327 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52P55327 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52P55327 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52P55327 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52P55327 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPD52P55327 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPD52P55327 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPD52P55327 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TPD52P55327 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TPD52P55327 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPD52P55327 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TPD52P55327 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TPD52P55327 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPD52P55327 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TPD52P55327 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TPD52P55327 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TPD52P55327 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TPD52P55327 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPD52P55327 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TPD52P55327 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TPD52P55327 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPD52P55327 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TPD52P55327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPD52P55327 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TPD52P55327 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPD52P55327 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TPD52P55327 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TPD52P55327 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPD52P55327 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPD52P55327 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPD52P55327 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPD52P55327 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPD52P55327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms