Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFAP4P55083 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFAP4P55083 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFAP4P55083 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFAP4P55083 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFAP4P55083 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms