Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCCSP53701 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCCSP53701 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCCSP53701 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCCSP53701 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCCSP53701 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCCSP53701 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCCSP53701 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCCSP53701 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HCCSP53701 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCCSP53701 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCCSP53701 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCCSP53701 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCCSP53701 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCCSP53701 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCCSP53701 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCCSP53701 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCCSP53701 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCCSP53701 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCCSP53701 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCCSP53701 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCCSP53701 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCCSP53701 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HCCSP53701 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCCSP53701 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HCCSP53701 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HCCSP53701 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCCSP53701 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HCCSP53701 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HCCSP53701 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCCSP53701 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HCCSP53701 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HCCSP53701 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCCSP53701 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCCSP53701 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HCCSP53701 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCCSP53701 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCCSP53701 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCCSP53701 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCCSP53701 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCCSP53701 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCCSP53701 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCCSP53701 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCCSP53701 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCCSP53701 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCCSP53701 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCCSP53701 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HCCSP53701 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCCSP53701 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCCSP53701 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HCCSP53701 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCCSP53701 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCCSP53701 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCCSP53701 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCCSP53701 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCCSP53701 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCCSP53701 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCCSP53701 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCCSP53701 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCCSP53701 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCCSP53701 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCCSP53701 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCCSP53701 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCCSP53701 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCCSP53701 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCCSP53701 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCCSP53701 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCCSP53701 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HCCSP53701 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCCSP53701 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCCSP53701 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCCSP53701 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCCSP53701 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCCSP53701 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCCSP53701 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCCSP53701 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCCSP53701 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCCSP53701 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCCSP53701 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCCSP53701 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCCSP53701 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCCSP53701 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCCSP53701 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCCSP53701 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCCSP53701 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCCSP53701 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCCSP53701 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCCSP53701 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCCSP53701 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCCSP53701 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCCSP53701 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCCSP53701 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCCSP53701 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCCSP53701 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HCCSP53701 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCCSP53701 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCCSP53701 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCCSP53701 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCCSP53701 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HCCSP53701 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms