Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RABGGTBP53611 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RABGGTBP53611 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RABGGTBP53611 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RABGGTBP53611 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RABGGTBP53611 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RABGGTBP53611 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RABGGTBP53611 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTBP53611 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RABGGTBP53611 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RABGGTBP53611 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RABGGTBP53611 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RABGGTBP53611 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RABGGTBP53611 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RABGGTBP53611 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RABGGTBP53611 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RABGGTBP53611 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RABGGTBP53611 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RABGGTBP53611 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RABGGTBP53611 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RABGGTBP53611 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RABGGTBP53611 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGGTBP53611 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RABGGTBP53611 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RABGGTBP53611 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RABGGTBP53611 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RABGGTBP53611 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RABGGTBP53611 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
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