Protein–RNA interactions for Protein: P52757

CHN2, Beta-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN2P52757 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHN2P52757 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHN2P52757 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN2P52757 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN2P52757 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN2P52757 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN2P52757 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN2P52757 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN2P52757 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHN2P52757 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHN2P52757 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN2P52757 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHN2P52757 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHN2P52757 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHN2P52757 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHN2P52757 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHN2P52757 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHN2P52757 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHN2P52757 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHN2P52757 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHN2P52757 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN2P52757 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHN2P52757 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHN2P52757 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHN2P52757 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHN2P52757 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHN2P52757 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHN2P52757 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN2P52757 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHN2P52757 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHN2P52757 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHN2P52757 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN2P52757 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN2P52757 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN2P52757 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN2P52757 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN2P52757 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN2P52757 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN2P52757 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN2P52757 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN2P52757 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHN2P52757 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHN2P52757 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHN2P52757 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHN2P52757 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHN2P52757 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHN2P52757 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHN2P52757 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHN2P52757 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHN2P52757 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHN2P52757 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHN2P52757 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHN2P52757 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHN2P52757 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHN2P52757 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN2P52757 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHN2P52757 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHN2P52757 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHN2P52757 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN2P52757 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN2P52757 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHN2P52757 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHN2P52757 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHN2P52757 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHN2P52757 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN2P52757 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHN2P52757 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHN2P52757 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHN2P52757 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN2P52757 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN2P52757 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHN2P52757 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHN2P52757 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHN2P52757 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHN2P52757 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHN2P52757 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHN2P52757 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHN2P52757 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHN2P52757 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHN2P52757 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHN2P52757 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHN2P52757 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN2P52757 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN2P52757 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN2P52757 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHN2P52757 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHN2P52757 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHN2P52757 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHN2P52757 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHN2P52757 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN2P52757 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHN2P52757 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN2P52757 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN2P52757 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN2P52757 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN2P52757 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHN2P52757 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHN2P52757 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHN2P52757 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHN2P52757 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms