Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA3P51805 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLXNA3P51805 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
PLXNA3P51805 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PLXNA3P51805 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA3P51805 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA3P51805 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLXNA3P51805 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLXNA3P51805 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLXNA3P51805 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNA3P51805 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PLXNA3P51805 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PLXNA3P51805 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLXNA3P51805 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNA3P51805 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLXNA3P51805 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLXNA3P51805 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms