Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MRE11P49959 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MRE11P49959 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
MRE11P49959 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MRE11P49959 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MRE11P49959 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MRE11P49959 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MRE11P49959 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MRE11P49959 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MRE11P49959 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MRE11P49959 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MRE11P49959 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
MRE11P49959 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
MRE11P49959 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
MRE11P49959 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MRE11P49959 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MRE11P49959 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MRE11P49959 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MRE11P49959 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MRE11P49959 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MRE11P49959 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MRE11P49959 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MRE11P49959 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MRE11P49959 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MRE11P49959 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MRE11P49959 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MRE11P49959 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MRE11P49959 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MRE11P49959 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MRE11P49959 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MRE11P49959 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MRE11P49959 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MRE11P49959 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MRE11P49959 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MRE11P49959 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MRE11P49959 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MRE11P49959 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MRE11P49959 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
MRE11P49959 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MRE11P49959 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MRE11P49959 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MRE11P49959 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MRE11P49959 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
MRE11P49959 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MRE11P49959 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MRE11P49959 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MRE11P49959 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MRE11P49959 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MRE11P49959 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MRE11P49959 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MRE11P49959 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MRE11P49959 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MRE11P49959 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MRE11P49959 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MRE11P49959 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MRE11P49959 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MRE11P49959 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MRE11P49959 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MRE11P49959 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MRE11P49959 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MRE11P49959 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MRE11P49959 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MRE11P49959 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MRE11P49959 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MRE11P49959 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MRE11P49959 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MRE11P49959 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MRE11P49959 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MRE11P49959 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
MRE11P49959 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MRE11P49959 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MRE11P49959 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MRE11P49959 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MRE11P49959 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MRE11P49959 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MRE11P49959 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MRE11P49959 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MRE11P49959 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MRE11P49959 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MRE11P49959 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MRE11P49959 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MRE11P49959 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MRE11P49959 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MRE11P49959 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MRE11P49959 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
MRE11P49959 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MRE11P49959 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MRE11P49959 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MRE11P49959 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MRE11P49959 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MRE11P49959 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MRE11P49959 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MRE11P49959 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MRE11P49959 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MRE11P49959 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MRE11P49959 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MRE11P49959 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MRE11P49959 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MRE11P49959 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MRE11P49959 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms