Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.8■■■■□ 3
VEGFBP49765 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VEGFBP49765 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
VEGFBP49765 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VEGFBP49765 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VEGFBP49765 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
VEGFBP49765 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VEGFBP49765 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
VEGFBP49765 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VEGFBP49765 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VEGFBP49765 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
VEGFBP49765 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
VEGFBP49765 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VEGFBP49765 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VEGFBP49765 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VEGFBP49765 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VEGFBP49765 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VEGFBP49765 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VEGFBP49765 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VEGFBP49765 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VEGFBP49765 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VEGFBP49765 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
VEGFBP49765 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
VEGFBP49765 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VEGFBP49765 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VEGFBP49765 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VEGFBP49765 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VEGFBP49765 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VEGFBP49765 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VEGFBP49765 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
VEGFBP49765 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VEGFBP49765 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
VEGFBP49765 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VEGFBP49765 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VEGFBP49765 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
VEGFBP49765 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VEGFBP49765 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
VEGFBP49765 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VEGFBP49765 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VEGFBP49765 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
VEGFBP49765 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms