Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD97P48960 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD97P48960 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD97P48960 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CD97P48960 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD97P48960 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD97P48960 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD97P48960 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CD97P48960 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD97P48960 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD97P48960 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD97P48960 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD97P48960 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD97P48960 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD97P48960 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD97P48960 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD97P48960 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD97P48960 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD97P48960 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD97P48960 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD97P48960 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD97P48960 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD97P48960 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD97P48960 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD97P48960 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD97P48960 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD97P48960 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD97P48960 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD97P48960 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD97P48960 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD97P48960 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD97P48960 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD97P48960 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD97P48960 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD97P48960 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD97P48960 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CD97P48960 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD97P48960 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD97P48960 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD97P48960 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD97P48960 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD97P48960 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD97P48960 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD97P48960 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD97P48960 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD97P48960 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD97P48960 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD97P48960 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD97P48960 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD97P48960 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD97P48960 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD97P48960 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CD97P48960 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD97P48960 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD97P48960 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD97P48960 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD97P48960 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD97P48960 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD97P48960 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD97P48960 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD97P48960 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD97P48960 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD97P48960 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD97P48960 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD97P48960 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD97P48960 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD97P48960 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD97P48960 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD97P48960 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD97P48960 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD97P48960 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD97P48960 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD97P48960 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD97P48960 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD97P48960 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD97P48960 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD97P48960 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD97P48960 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD97P48960 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD97P48960 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD97P48960 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD97P48960 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD97P48960 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD97P48960 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD97P48960 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD97P48960 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD97P48960 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD97P48960 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD97P48960 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD97P48960 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD97P48960 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD97P48960 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD97P48960 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CD97P48960 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD97P48960 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms