Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A3P48764 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A3P48764 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A3P48764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A3P48764 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A3P48764 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9A3P48764 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3P48764 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A3P48764 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A3P48764 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC9A3P48764 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A3P48764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms