Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFX2P48378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFX2P48378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFX2P48378 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX2P48378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX2P48378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX2P48378 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX2P48378 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX2P48378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX2P48378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX2P48378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX2P48378 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX2P48378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFX2P48378 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFX2P48378 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFX2P48378 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFX2P48378 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFX2P48378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFX2P48378 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX2P48378 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX2P48378 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX2P48378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX2P48378 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX2P48378 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX2P48378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX2P48378 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX2P48378 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX2P48378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX2P48378 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX2P48378 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX2P48378 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX2P48378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX2P48378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX2P48378 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX2P48378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX2P48378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFX2P48378 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX2P48378 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX2P48378 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX2P48378 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX2P48378 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX2P48378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX2P48378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX2P48378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX2P48378 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX2P48378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX2P48378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX2P48378 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX2P48378 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX2P48378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX2P48378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX2P48378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX2P48378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX2P48378 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX2P48378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX2P48378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX2P48378 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX2P48378 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX2P48378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX2P48378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX2P48378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX2P48378 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX2P48378 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX2P48378 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX2P48378 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX2P48378 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX2P48378 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX2P48378 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX2P48378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX2P48378 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX2P48378 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX2P48378 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX2P48378 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX2P48378 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX2P48378 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX2P48378 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX2P48378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX2P48378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX2P48378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX2P48378 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX2P48378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX2P48378 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX2P48378 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX2P48378 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX2P48378 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX2P48378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX2P48378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX2P48378 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX2P48378 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX2P48378 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX2P48378 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX2P48378 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX2P48378 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms