Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
IQGAP1P46940 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IQGAP1P46940 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IQGAP1P46940 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
IQGAP1P46940 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
IQGAP1P46940 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
IQGAP1P46940 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
IQGAP1P46940 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
IQGAP1P46940 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
IQGAP1P46940 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
IQGAP1P46940 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
IQGAP1P46940 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
IQGAP1P46940 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
IQGAP1P46940 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
IQGAP1P46940 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
IQGAP1P46940 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
IQGAP1P46940 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
IQGAP1P46940 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
IQGAP1P46940 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
IQGAP1P46940 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
IQGAP1P46940 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
IQGAP1P46940 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
IQGAP1P46940 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
IQGAP1P46940 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
IQGAP1P46940 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
IQGAP1P46940 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
IQGAP1P46940 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
IQGAP1P46940 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
IQGAP1P46940 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
IQGAP1P46940 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
IQGAP1P46940 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
IQGAP1P46940 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
IQGAP1P46940 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
IQGAP1P46940 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
IQGAP1P46940 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
IQGAP1P46940 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
IQGAP1P46940 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
IQGAP1P46940 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
IQGAP1P46940 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
IQGAP1P46940 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
IQGAP1P46940 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
IQGAP1P46940 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
IQGAP1P46940 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
IQGAP1P46940 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
IQGAP1P46940 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
IQGAP1P46940 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms