Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCG1P45844 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCG1P45844 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCG1P45844 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCG1P45844 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCG1P45844 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCG1P45844 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCG1P45844 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCG1P45844 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms