Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCG1P45844 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCG1P45844 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCG1P45844 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCG1P45844 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCG1P45844 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCG1P45844 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCG1P45844 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCG1P45844 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCG1P45844 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCG1P45844 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCG1P45844 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCG1P45844 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCG1P45844 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCG1P45844 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCG1P45844 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCG1P45844 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCG1P45844 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms