Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSR1P43307 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSR1P43307 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSR1P43307 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSR1P43307 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSR1P43307 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSR1P43307 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSR1P43307 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SSR1P43307 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSR1P43307 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSR1P43307 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSR1P43307 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSR1P43307 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSR1P43307 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSR1P43307 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSR1P43307 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSR1P43307 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSR1P43307 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSR1P43307 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSR1P43307 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSR1P43307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSR1P43307 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSR1P43307 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSR1P43307 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSR1P43307 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSR1P43307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSR1P43307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSR1P43307 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSR1P43307 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSR1P43307 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSR1P43307 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSR1P43307 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSR1P43307 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSR1P43307 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSR1P43307 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSR1P43307 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSR1P43307 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSR1P43307 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSR1P43307 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SSR1P43307 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSR1P43307 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSR1P43307 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSR1P43307 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSR1P43307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSR1P43307 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSR1P43307 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSR1P43307 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SSR1P43307 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSR1P43307 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSR1P43307 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSR1P43307 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SSR1P43307 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSR1P43307 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSR1P43307 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSR1P43307 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSR1P43307 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSR1P43307 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSR1P43307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSR1P43307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSR1P43307 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSR1P43307 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSR1P43307 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSR1P43307 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSR1P43307 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSR1P43307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SSR1P43307 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSR1P43307 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSR1P43307 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSR1P43307 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSR1P43307 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSR1P43307 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSR1P43307 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSR1P43307 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSR1P43307 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSR1P43307 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSR1P43307 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSR1P43307 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSR1P43307 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSR1P43307 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSR1P43307 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSR1P43307 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSR1P43307 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSR1P43307 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSR1P43307 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSR1P43307 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSR1P43307 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSR1P43307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSR1P43307 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSR1P43307 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSR1P43307 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSR1P43307 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSR1P43307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSR1P43307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSR1P43307 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSR1P43307 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSR1P43307 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SSR1P43307 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSR1P43307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSR1P43307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSR1P43307 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms