Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A3P40879 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC26A3P40879 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC26A3P40879 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A3P40879 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC26A3P40879 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A3P40879 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC26A3P40879 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC26A3P40879 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC26A3P40879 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC26A3P40879 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC26A3P40879 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC26A3P40879 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC26A3P40879 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC26A3P40879 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC26A3P40879 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC26A3P40879 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC26A3P40879 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms