Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX19P40855 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX19P40855 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX19P40855 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX19P40855 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX19P40855 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX19P40855 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX19P40855 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX19P40855 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX19P40855 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX19P40855 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX19P40855 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX19P40855 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PEX19P40855 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PEX19P40855 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX19P40855 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX19P40855 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX19P40855 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX19P40855 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX19P40855 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PEX19P40855 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX19P40855 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX19P40855 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX19P40855 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PEX19P40855 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX19P40855 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX19P40855 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX19P40855 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEX19P40855 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX19P40855 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX19P40855 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX19P40855 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX19P40855 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX19P40855 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX19P40855 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX19P40855 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX19P40855 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX19P40855 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX19P40855 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX19P40855 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX19P40855 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX19P40855 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX19P40855 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX19P40855 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX19P40855 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX19P40855 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX19P40855 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX19P40855 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX19P40855 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX19P40855 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX19P40855 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX19P40855 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX19P40855 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX19P40855 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PEX19P40855 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX19P40855 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX19P40855 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX19P40855 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX19P40855 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX19P40855 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX19P40855 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX19P40855 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX19P40855 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX19P40855 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX19P40855 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX19P40855 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX19P40855 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX19P40855 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX19P40855 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX19P40855 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX19P40855 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX19P40855 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX19P40855 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX19P40855 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX19P40855 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX19P40855 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX19P40855 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX19P40855 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX19P40855 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX19P40855 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX19P40855 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX19P40855 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX19P40855 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX19P40855 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX19P40855 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX19P40855 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX19P40855 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX19P40855 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX19P40855 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX19P40855 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX19P40855 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX19P40855 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX19P40855 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX19P40855 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX19P40855 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX19P40855 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX19P40855 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX19P40855 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX19P40855 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PEX19P40855 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms