Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPGP40121 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPGP40121 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPGP40121 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPGP40121 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPGP40121 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPGP40121 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAPGP40121 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPGP40121 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPGP40121 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPGP40121 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPGP40121 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAPGP40121 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPGP40121 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAPGP40121 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAPGP40121 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAPGP40121 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAPGP40121 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPGP40121 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAPGP40121 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPGP40121 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPGP40121 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPGP40121 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPGP40121 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAPGP40121 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPGP40121 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPGP40121 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPGP40121 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPGP40121 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPGP40121 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPGP40121 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPGP40121 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPGP40121 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPGP40121 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPGP40121 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPGP40121 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPGP40121 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPGP40121 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPGP40121 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPGP40121 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPGP40121 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPGP40121 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPGP40121 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPGP40121 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPGP40121 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPGP40121 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPGP40121 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPGP40121 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPGP40121 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPGP40121 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPGP40121 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPGP40121 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPGP40121 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPGP40121 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPGP40121 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPGP40121 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPGP40121 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPGP40121 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPGP40121 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPGP40121 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPGP40121 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPGP40121 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPGP40121 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPGP40121 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPGP40121 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPGP40121 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPGP40121 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPGP40121 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPGP40121 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPGP40121 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPGP40121 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPGP40121 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPGP40121 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPGP40121 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPGP40121 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPGP40121 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPGP40121 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPGP40121 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPGP40121 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPGP40121 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPGP40121 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPGP40121 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPGP40121 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPGP40121 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPGP40121 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPGP40121 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPGP40121 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPGP40121 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPGP40121 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPGP40121 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPGP40121 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPGP40121 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPGP40121 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPGP40121 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPGP40121 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPGP40121 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPGP40121 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPGP40121 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPGP40121 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPGP40121 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1015.3 ms