Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS4P35443 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THBS4P35443 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THBS4P35443 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS4P35443 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THBS4P35443 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS4P35443 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THBS4P35443 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THBS4P35443 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS4P35443 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THBS4P35443 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS4P35443 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THBS4P35443 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS4P35443 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THBS4P35443 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS4P35443 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS4P35443 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THBS4P35443 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS4P35443 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THBS4P35443 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THBS4P35443 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THBS4P35443 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THBS4P35443 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THBS4P35443 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THBS4P35443 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THBS4P35443 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS4P35443 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS4P35443 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THBS4P35443 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THBS4P35443 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS4P35443 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS4P35443 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS4P35443 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THBS4P35443 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THBS4P35443 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THBS4P35443 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THBS4P35443 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THBS4P35443 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THBS4P35443 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THBS4P35443 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS4P35443 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THBS4P35443 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THBS4P35443 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS4P35443 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS4P35443 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS4P35443 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS4P35443 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS4P35443 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS4P35443 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS4P35443 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS4P35443 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS4P35443 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS4P35443 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS4P35443 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS4P35443 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS4P35443 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS4P35443 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS4P35443 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS4P35443 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS4P35443 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS4P35443 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS4P35443 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS4P35443 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
THBS4P35443 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS4P35443 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THBS4P35443 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS4P35443 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS4P35443 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS4P35443 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS4P35443 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS4P35443 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS4P35443 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS4P35443 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS4P35443 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THBS4P35443 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THBS4P35443 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS4P35443 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS4P35443 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS4P35443 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS4P35443 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS4P35443 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS4P35443 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS4P35443 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS4P35443 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS4P35443 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS4P35443 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THBS4P35443 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THBS4P35443 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THBS4P35443 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THBS4P35443 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
THBS4P35443 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THBS4P35443 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS4P35443 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS4P35443 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS4P35443 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS4P35443 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THBS4P35443 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THBS4P35443 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THBS4P35443 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THBS4P35443 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms