Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RYKP34925 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RYKP34925 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RYKP34925 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RYKP34925 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RYKP34925 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RYKP34925 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RYKP34925 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RYKP34925 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYKP34925 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYKP34925 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RYKP34925 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RYKP34925 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RYKP34925 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RYKP34925 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RYKP34925 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RYKP34925 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RYKP34925 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RYKP34925 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RYKP34925 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYKP34925 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYKP34925 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYKP34925 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYKP34925 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RYKP34925 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RYKP34925 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RYKP34925 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYKP34925 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RYKP34925 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYKP34925 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYKP34925 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RYKP34925 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RYKP34925 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYKP34925 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RYKP34925 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYKP34925 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RYKP34925 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RYKP34925 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RYKP34925 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYKP34925 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RYKP34925 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RYKP34925 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RYKP34925 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYKP34925 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RYKP34925 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYKP34925 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYKP34925 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYKP34925 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYKP34925 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYKP34925 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RYKP34925 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYKP34925 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RYKP34925 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RYKP34925 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RYKP34925 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RYKP34925 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RYKP34925 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RYKP34925 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYKP34925 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYKP34925 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYKP34925 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RYKP34925 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYKP34925 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYKP34925 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYKP34925 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYKP34925 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RYKP34925 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYKP34925 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYKP34925 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYKP34925 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RYKP34925 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RYKP34925 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RYKP34925 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RYKP34925 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYKP34925 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RYKP34925 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYKP34925 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RYKP34925 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYKP34925 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYKP34925 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYKP34925 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYKP34925 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYKP34925 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYKP34925 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYKP34925 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RYKP34925 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RYKP34925 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RYKP34925 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RYKP34925 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYKP34925 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYKP34925 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RYKP34925 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RYKP34925 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYKP34925 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYKP34925 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYKP34925 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYKP34925 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYKP34925 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYKP34925 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RYKP34925 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms