Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF2RBP32927 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSF2RBP32927 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RBP32927 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RBP32927 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RBP32927 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RBP32927 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF2RBP32927 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RBP32927 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF2RBP32927 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSF2RBP32927 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF2RBP32927 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF2RBP32927 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF2RBP32927 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CSF2RBP32927 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSF2RBP32927 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSF2RBP32927 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSF2RBP32927 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSF2RBP32927 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSF2RBP32927 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSF2RBP32927 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CSF2RBP32927 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSF2RBP32927 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF2RBP32927 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF2RBP32927 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CSF2RBP32927 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CSF2RBP32927 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms