Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRS3P32247 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRS3P32247 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRS3P32247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRS3P32247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRS3P32247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRS3P32247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRS3P32247 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRS3P32247 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRS3P32247 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRS3P32247 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRS3P32247 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRS3P32247 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRS3P32247 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRS3P32247 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRS3P32247 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRS3P32247 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRS3P32247 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRS3P32247 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRS3P32247 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRS3P32247 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRS3P32247 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRS3P32247 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRS3P32247 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRS3P32247 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRS3P32247 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRS3P32247 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRS3P32247 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRS3P32247 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRS3P32247 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRS3P32247 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRS3P32247 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRS3P32247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRS3P32247 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRS3P32247 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRS3P32247 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRS3P32247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRS3P32247 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRS3P32247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRS3P32247 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRS3P32247 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRS3P32247 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRS3P32247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRS3P32247 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRS3P32247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRS3P32247 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRS3P32247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRS3P32247 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRS3P32247 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRS3P32247 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRS3P32247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRS3P32247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRS3P32247 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRS3P32247 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRS3P32247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRS3P32247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRS3P32247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRS3P32247 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRS3P32247 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRS3P32247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRS3P32247 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRS3P32247 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRS3P32247 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRS3P32247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRS3P32247 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRS3P32247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRS3P32247 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRS3P32247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRS3P32247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRS3P32247 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRS3P32247 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRS3P32247 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRS3P32247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRS3P32247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRS3P32247 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRS3P32247 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRS3P32247 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRS3P32247 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRS3P32247 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRS3P32247 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRS3P32247 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRS3P32247 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRS3P32247 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRS3P32247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRS3P32247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRS3P32247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRS3P32247 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRS3P32247 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRS3P32247 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRS3P32247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRS3P32247 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRS3P32247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRS3P32247 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRS3P32247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRS3P32247 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRS3P32247 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRS3P32247 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRS3P32247 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRS3P32247 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRS3P32247 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms