Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
OTX2P32243 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTX2P32243 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTX2P32243 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTX2P32243 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTX2P32243 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTX2P32243 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTX2P32243 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTX2P32243 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTX2P32243 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTX2P32243 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTX2P32243 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTX2P32243 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTX2P32243 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTX2P32243 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTX2P32243 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
OTX2P32243 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTX2P32243 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTX2P32243 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
OTX2P32243 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTX2P32243 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTX2P32243 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
OTX2P32243 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OTX2P32243 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTX2P32243 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTX2P32243 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTX2P32243 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTX2P32243 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTX2P32243 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTX2P32243 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTX2P32243 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTX2P32243 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTX2P32243 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTX2P32243 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OTX2P32243 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OTX2P32243 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTX2P32243 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OTX2P32243 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OTX2P32243 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OTX2P32243 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTX2P32243 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTX2P32243 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTX2P32243 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTX2P32243 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTX2P32243 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTX2P32243 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTX2P32243 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTX2P32243 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTX2P32243 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OTX2P32243 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTX2P32243 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTX2P32243 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTX2P32243 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTX2P32243 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTX2P32243 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTX2P32243 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTX2P32243 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTX2P32243 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTX2P32243 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTX2P32243 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTX2P32243 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTX2P32243 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTX2P32243 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTX2P32243 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTX2P32243 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTX2P32243 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTX2P32243 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTX2P32243 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTX2P32243 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTX2P32243 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTX2P32243 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTX2P32243 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTX2P32243 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTX2P32243 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTX2P32243 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTX2P32243 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OTX2P32243 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTX2P32243 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTX2P32243 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTX2P32243 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTX2P32243 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTX2P32243 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTX2P32243 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTX2P32243 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTX2P32243 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTX2P32243 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTX2P32243 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTX2P32243 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTX2P32243 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
OTX2P32243 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OTX2P32243 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
OTX2P32243 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTX2P32243 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTX2P32243 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTX2P32243 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTX2P32243 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTX2P32243 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTX2P32243 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTX2P32243 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTX2P32243 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms