Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDC25CP30307 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDC25CP30307 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC25CP30307 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC25CP30307 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC25CP30307 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC25CP30307 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC25CP30307 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC25CP30307 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC25CP30307 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC25CP30307 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC25CP30307 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC25CP30307 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC25CP30307 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDC25CP30307 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC25CP30307 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms