Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGA1P29973 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNGA1P29973 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNGA1P29973 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNGA1P29973 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNGA1P29973 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CNGA1P29973 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGA1P29973 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGA1P29973 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGA1P29973 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CNGA1P29973 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGA1P29973 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CNGA1P29973 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CNGA1P29973 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CNGA1P29973 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CNGA1P29973 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CNGA1P29973 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CNGA1P29973 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CNGA1P29973 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CNGA1P29973 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGA1P29973 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CNGA1P29973 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms